- Struktura
- karakteristike
- Značajke
- Glikoliza i glukoneogeneza
- Put pentose fosfata i Calvin ciklus
- Metabolizam fruktoze
- Preko Entner-Doudoroffa
- Reference
Gliceraldehid 3-fosfat (GAP) je metabolit glikolize (ime je grčko, glicos = slatko ili šećer; liza = rupture), koji je metabolički put koji pretvara molekule glukoze u dvije molekule u piruvat proizvode energiju u obliku adenozin trifosfata (ATP).
U stanicama gliceraldehid 3-fosfat povezuje glikolizu s glukoneogenezom i pentos fosfatnim putem. U fotosintetskim organizmima gliceraldehid 3-fosfat, koji dolazi od fiksacije ugljičnog dioksida, koristi se za biosintezu šećera. U jetri metabolizam fruktoze stvara GAP koji je ugrađen u glikolizu.
Izvor: Benjah-bmm27
Struktura
Gliceraldehid 3-fosfat je fosforilirani šećer koji ima tri ugljika. Njegova empirijska formula je C 3 H 7 O 6 P. Aldehidna skupina (-CHO) je ugljik 1 (C-1), hidroksimetilen grupu (CHOH) 2 je ugljik (C-2), a hidroksimetilna skupina (-CH 2 OH) 3 je ugljik (C3). Potonji tvori vezu s fosfatnom skupinom (fosfoesterska veza).
Konfiguracija gliceraldehid 3-fosfata na kiralnom C-2 je D. Po dogovoru, u odnosu na kiralni ugljik, u Fischerovoj projekciji aldehidna skupina predstavljena je prema gore, hidroksimetilfosfatna grupa prema dolje, hidroksilna grupa prema dolje. desno i atom vodika s lijeve strane.
karakteristike
Gliceraldehid 3-fosfat ima molekularnu masu 170,06 g / mol. Standardna Gibbsova promjena promene energije (ΔGº) za svaku reakciju mora se izračunati zbrajanjem promjene slobodne energije proizvoda i oduzimanjem zbroja promjene slobodne energije reaktanata.
Na taj se način utvrđuje varijacija slobodne energije (ΔGº) stvaranja gliceraldehidnog 3-fosfata koja je -1,285 KJ × mol -1. Prema konvenciji, u standardnom stanju od 25 ° C i 1 atm, slobodna energija čistih elemenata je nula.
Značajke
Glikoliza i glukoneogeneza
Glikoliza je prisutna u svim stanicama. Podijeljen je u dvije faze: 1) faza ulaganja energije i sinteze metabolita s velikim potencijalom prijenosa fosfatne skupine, poput gliceraldehid 3-fosfata (GAP); 2) Korak sinteze ATP iz molekula visokog potencijala prijenosa fosfatne skupine.
Gliceraldehid 3-fosfat i dihidroksiaceton fosfat nastaju iz fruktoze 1,6-bisfosfata, reakcije koju katalizira enzim aldolaza. Gliceraldehid 3-fosfat se pretvara u 1,3-bisfosfoglicerat (1,3BPG), reakcijom kataliziranom enzimom GAP dehidrogenazom.
GAP dehidrogenaza katalizira oksidaciju ugljikovog atoma aldehida i prenosi fosfatnu skupinu. Tako nastaje miješani anhidrid (1,3BPG) u kojem su acilna skupina i atom fosfora skloni nukleofilnoj reakciji napada.
Zatim, u reakciji koju katalizira 3-fosfoglicerat kinaza, 1,3BPG prenosi fosfatnu skupinu iz ugljika 1 u ADP, formirajući ATP.
Budući da su reakcije katalizirane aldolaza, GAP dehidrogenaza i 3-fosfoglicerat kinaza u ravnoteži (ΔGº ~ 0), one su reverzibilne, te su tako dio puta glukoneogeneze (ili nove sinteze glukoze).
Put pentose fosfata i Calvin ciklus
U pentoznom fosfatnom putu nastaju gliceraldehid 3-fosfat (GAP) i fruktoza 6-fosfat (F6P) rezanjem reakcija i stvaranjem CC veza, iz pentoze, ksiluloze 5-fosfata i riboze 5 -fosfat.
Gliceraldehid 3-fosfat može slijediti put glukoneogeneze i formirati glukozni 6-fosfat, koji nastavlja put pentoznog fosfata. Glukoza se može u potpunosti oksidirati da bi nastala šest molekula CO 2 kroz oksidativni korak pentoz fosfatnog puta.
U ciklusu Calvin, CO 2 je fiksiran kao 3-fosfoglicerat, u reakciji kataliziranoj ribuloza bisfosfat karboksilazom. Tada se 3-fosfoglicerat reducira NADH djelovanjem enzima nazvanog GAP dehidrogenaza.
2 GAP molekule potrebne su za biosintezu heksoze, poput glukoze, koja se koristi za biosintezu škroba ili celuloze u biljkama.
Metabolizam fruktoze
Enzim fruktokinaza katalizira fosforilaciju fruktoze ATP-om na C-1, formirajući fruktozu 1-fosfat. Aldolaza A, koja se nalazi u mišićima, specifična je za fruktozu 1,6-bisfosfat kao supstrat. Aldolaza B nalazi se u jetri i specifična je za fruktozu 1-fosfat kao supstrat.
Aldolaza B katalizira aldolsku razgradnju fruktoze 1-fosfata i stvara dihidroksiaceton fosfat i gliceraldehid. Gliceraldehid kinaza katalizira fosforilaciju gliceraldehida ATP-om, formirajući glikolitički intermedijar, gliceraldehid 3-fosfat (GAP).
Na drugačiji način, gliceraldehid se transformira u glicerol alkohol-dehidrogenazom koja koristi NADH kao supstrat davatelja elektrona. Glicerol kinaza tada fosforilira glicerol kroz ATP, tvoreći glicerol fosfat. Potonji metabolit se ponovno oksidira, formirajući dihidroksiaceton fosfat (DHAP) i NADH.
DHAP se pretvara u GAP enzim trioznom fosfatnom izomerazom. Na taj se način fruktoza pretvara u metabolite glikolize. Međutim, fruktoza koja se daje intravenski može uzrokovati ozbiljnu štetu, koja se sastoji od drastičnog iscrpljivanja unutarćelijskog fosfata i ATP-a. Laktacidoza se čak pojavljuje.
Šteta od fruktoze nastaje zbog činjenice da nema zadanih vrijednosti koje katabolizam glukoze normalno ima. Prvo, fruktoza ulazi u mišiće putem GLUT5, koji je neovisan o inzulinu.
Drugo, fruktoza se izravno pretvara u GAP i na taj način zaobilazi regulaciju enzima foshofrukt kinaza (PFK) na početku glikolize.
Preko Entner-Doudoroffa
Glikoliza je univerzalni put katabolizma glukoze. Međutim, neke bakterije alternativno koriste Entner-Doudoroff put. Taj put uključuje šest koraka kataliziranih enzimima, u kojima se glukoza pretvara u GAP i piruvat, koji su dva krajnja produkta ovog puta.
GAP i piruvat pretvaraju se u etanol reakcijama alkoholnog vrenja.
Reference
- Berg, JM, Tymoczco, JL, Stryer, L. 2015. Biochemistry. Kratki tečaj. WH Freeman, New York.
- Miesfeld, RL, McEvoy, MM 2017. Biokemija. WW Norton, New York.
- Nelson, DL, Cox, MM 2017. Lehningerovi principi biokemije. WH Freeman, New York.
- Salway JG 2004. Metabolizam na prvi pogled. Blackwell, Malden.
- Voet, D., Voet, JG, Pratt, CW 2008. Osnove biokemije: život na molekularnoj razini. Wiley, Hoboken.