Episom u području genetike, je molekula DNA koja je sposobna autonomnog repliciranja u citoplazmi stanice domaćina, te fizički integriran u kromosom stanice domaćina, i repliciraju se kao jedne molekule (na koju nazivamo kointegraciranom).
Epizoda se, dakle, može tumačiti kao oblik suživota, a ne kao vrsta replika. Zapravo, za neke se autore transpozoni i insercijski nizovi mogu smatrati epizodama, jer se efektivno provode na kromosomu stanice domaćina, iako u citoplazmi nikada nemaju samostalno i autonomno postojanje.
Nasuprot tome, u eukariotskim stanicama epizod se više odnosi na virusne replikone koji koegzistiraju kao plazmidi u zaraženim stanicama nego na viruse koji se mogu integrirati u genom stanice domaćina.
Ovo nije jedina instanca u kojoj ista riječ znači različite stvari kod eukariota i prokariota (na primjer, izraz transformacija). Epizodi imaju bogatu povijest u razvoju moderne genetike, jer su pomogli otkrivanju zanimljivih pojava povezanih s nasljednošću.
Epizodi koji su bakteriofagi
Drugi od najpoznatijih primjera epizoda je faktor plodnosti, ili plazmid F. Ponekad, ovisno o nukleotidnoj konstituciji bakterije domaćina (npr. E. coli), kružni plazmid rekombinira s homolognim mjestima koja su prisutna na kromosomu. od bakterije koja daje kointegraciju.
Odnosno, plazmid se može umnožiti u malom broju kopija u citoplazmi bakterije, ili ako je integriran, replicirati kao cjelina u kopiji koji odgovara broju bakterije bez F (općenito jednog).
U svom epizomnom stanju, F daje bakteriji sposobnost stvaranja velikog broja rekombinanta nakon postupka konjugacije.
Za bakteriju F + (tj. Koja posjeduje autonomni F plazmid) koja je podvrgnuta umetanju ovog elementa se kaže da je Hfr (za veliku učestalost rekombinacije, za akronim na engleskom), budući da je događajem konjugacije teoretski sposoban da "povuče" cijeli bakterijski kromosom u F-bakteriju (tj. nedostaje faktor plodnosti ili plazmid F).
Općenito, sekvence koje osiguravaju homologiju (a samim tim, sličnost i komplementarnost) između F plazmida i bakterijskog kromosoma, tako da je provjeren postupak rekombinacije specifičan za mjesto koji uzrokuje nastanak kointegrata, sekvencije umetanja.
Episomi u eukariotskim stanicama
Iz povijesnih razloga, termin epizom (iznad + tijela) uvijek je bio povezan s plazmidom, koji izvorno potječe iz svijeta ekstrahromosomskih elemenata u prokariotima.
Pronalaženjem sličnih elemenata u eukariotima, upotreba istih usvojena je za označavanje molekula virusnih genoma sposobnih da se sami razmnožavaju u ovoj vrsti zaraženih stanica sa svojstvima koja su slična onima plazmida u prokariotima.
To jest, u eukariotskim stanicama zaraženim virusima možemo naći u nekim slučajevima da virus, kao dio svog replikativnog ciklusa, koegzistira u stanici kao kružna molekula DNK slična drugim replikovima opisanim, na primjer, u bakterijama.
Najčešći poznati virusi koji mogu postojati kao autonomno umnožavajuće kružne molekule DNK (iz kromosoma domaćina) pripadaju obiteljima Herpesviridae, Adenoviridae i Polyomaviridae.
Nijedan od njih, međutim, nije integriran u genom domaćina, zbog čega se može smatrati da se repliciraju kao plazmidi i da ne zadovoljavaju svojstvenu kvalitetu koja karakterizira epizod: integriraju se u genom domaćina.
Iako je predloženo uklanjanje termina, možda će to samo dodati zbunjenost temi koja je sama po sebi prilično složena.
Zaključci
Ukratko, možemo reći da je epitet, etimološki gledano, genetski element autonomne replikacije koji može u koegzistenciji postojati kao slobodna molekula DNK, ili fizički integriran u onu domaćina.
S gledišta genetike, međutim, epizoda je plazmid ili virus koji se može integrirati u prokariotski genom, ili biti jedna od vrsta plazmida koje eukariotska stanica može lučiti.
Zanimljivo je da se virusi koji se mogu umetnuti u genom eukariotskog domaćina (retrovirus) ne smatraju epizodama.
Reference
- Brock, TD 1990. Pojava bakterijske genetike. Laboratorijska presa hladne proljeće. Cold Spring Harbor, MA, Sjedinjene Američke Države.
- Griffiths, AJF, Wessler, SR, Carroll, SB i Doebley, J. Uvod u genetsku analizu. WH Freeman & Co, McMillan Publishers. London, Ujedinjeno Kraljevstvo.
- Hayes, W. 1971. Genetika bakterija i njihovi virusi, drugo izdanje. Blackwell znanstvene publikacije.
- Jacob, F. i Wollman, EL 1958. Les epizode, elementi génétiques ajoutés. Comptes Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154–156.
- Levy, JA, Fraenkel-Conrat, H. i Owens, OS 1994. Virologija, 3. izdanje. Dvorana Prentice. Englerwood Cliffs, NJ, Sjedinjene Države.